2.6.-Flotilla de Submarinos (FLOSUB). La organización del Arma Submarina es la siguiente: 

Almirante de la Flota (ALFLOT)
Comandante de la Flotilla de Submarinos (COMSUBMAR)
Estado Mayor 

Base de Submarinos

Sección de Adiestramiento
Centro de Programas Tácticos de Submarinos (CPTSUB)
Submarino Galerna
Submarino Mistral
Submarino Tramontana
PREJUTAC
PREGRUSUB
GRUSUB. Secretaria
ALPER
ADIENA
DIRESUBMAR
Jefatura de Estudios
Armas
Táctica. Secc. Idiomas
Energía y Propulsión
Secc. Técnica